Esta línea es el servidor informando de que un tick tardó mucho más de lo que debía. Es un síntoma, no un diagnóstico, y lo útil es el número que te da.
Lo que estás viendo
Can't keep up! Is the server overloaded? Running 2043ms or 40 ticks behind- Aparece a ráfagas, o de forma constante mientras se juega.
Por qué pasa
Un tick debería tardar 50 ms. Cuando uno tarda mucho más, el servidor imprime esto y se salta ticks para recuperar, que es por lo que el mundo pega saltos visibles. La razón puede ser un plugin lento, demasiadas entidades, una pausa del recolector o trabajo pesado de disco.
Qué hacer
- Mira cuándo aparecen los mensajes
Al arrancar y durante un guardado grande del mundo son normales y no hay que perseguirlos. Durante el juego normal, no lo son.
- Comprueba si las duraciones se parecen
Mensajes repetidos de duración parecida a intervalos regulares apuntan a pausas del recolector de basura. Duraciones muy dispares apuntan a carga de trabajo: plugins, entidades o generación de chunks.
- Perfila mientras salen
/spark profiler start, deja que aparezcan varios, y para. El informe dice qué se llevó el tiempo.
Los mensajes dejan de salir durante el juego normal, y tps se mantiene por encima de 19,5 con la gente habitual conectada.
Unas cuantas de estas líneas después de un reinicio son esperables: el servidor está cargando chunks y plugins a la vez. Solo los mensajes sostenidos durante el juego indican un problema real.